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湖水色彩的寨沟起因，主要源于湖水对太阳光的蓝色散射、反射和吸收。寨沟太阳光或自然光是蓝色由不同波长的单色光组合而成的复色。

光，寨沟在光谱中，蓝色由红光至紫光，寨沟波长逐渐减小。蓝色九寨沟的寨沟湖水呈现艳丽的蓝色，说明湖水中短波长的蓝色散射远大于长波长，这就是寨沟瑞利散射(RAYLEIGHSCATTERING)效应。

瑞利散射效应在九寨沟的蓝色湖水中之所以尤为突出，主要是寨沟因沟内植被郁闭度高、水循环条件较畅通以及石灰华对悬移质的蓝色固定作用，从而使水中悬浮物、寨沟有机物、浮游生物极少，湖水的洁净度和透明度极高。湖水中常见的CA2+、MG2+，HCO3-等离子也有增强短波光散射的作用。同时由于湖水透明度高，湖底的灰白色钙华、黄绿色藻类对透射光的选择性吸收和反射，也增加了湖水色彩的层次和变化。

另外，九寨沟的湖泊处于地形起伏很大的深切峡谷中，不同地段同一时间、同一地段不同时间，太阳光的入射角及入射量、湖水表面对光的反射状况和湖水的透明度都有很大的变化。

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